Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms