Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB15P59190 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB15P59190 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB15P59190 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB15P59190 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB15P59190 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB15P59190 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB15P59190 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB15P59190 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB15P59190 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB15P59190 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB15P59190 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB15P59190 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB15P59190 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB15P59190 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB15P59190 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB15P59190 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB15P59190 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB15P59190 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB15P59190 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB15P59190 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB15P59190 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB15P59190 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB15P59190 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB15P59190 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB15P59190 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB15P59190 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB15P59190 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB15P59190 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB15P59190 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB15P59190 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB15P59190 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB15P59190 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB15P59190 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB15P59190 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB15P59190 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB15P59190 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB15P59190 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB15P59190 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB15P59190 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB15P59190 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB15P59190 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB15P59190 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB15P59190 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB15P59190 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB15P59190 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB15P59190 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB15P59190 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB15P59190 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB15P59190 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB15P59190 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB15P59190 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB15P59190 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB15P59190 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB15P59190 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB15P59190 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB15P59190 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB15P59190 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB15P59190 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB15P59190 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB15P59190 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB15P59190 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB15P59190 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB15P59190 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB15P59190 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB15P59190 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB15P59190 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB15P59190 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB15P59190 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB15P59190 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB15P59190 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB15P59190 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB15P59190 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB15P59190 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB15P59190 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB15P59190 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB15P59190 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB15P59190 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB15P59190 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB15P59190 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB15P59190 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB15P59190 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB15P59190 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB15P59190 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB15P59190 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB15P59190 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB15P59190 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB15P59190 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB15P59190 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB15P59190 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB15P59190 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB15P59190 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB15P59190 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB15P59190 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB15P59190 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB15P59190 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB15P59190 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB15P59190 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB15P59190 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB15P59190 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms