Protein–RNA interactions for Protein: P57081

WDR4, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit WDR4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR4P57081 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR4P57081 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR4P57081 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR4P57081 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR4P57081 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR4P57081 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR4P57081 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR4P57081 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR4P57081 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR4P57081 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR4P57081 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR4P57081 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR4P57081 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR4P57081 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR4P57081 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR4P57081 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR4P57081 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR4P57081 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR4P57081 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR4P57081 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR4P57081 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR4P57081 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR4P57081 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR4P57081 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR4P57081 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR4P57081 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR4P57081 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR4P57081 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR4P57081 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR4P57081 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR4P57081 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR4P57081 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR4P57081 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
WDR4P57081 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
WDR4P57081 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
WDR4P57081 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
WDR4P57081 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
WDR4P57081 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
WDR4P57081 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
WDR4P57081 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
WDR4P57081 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
WDR4P57081 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR4P57081 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR4P57081 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR4P57081 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR4P57081 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR4P57081 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR4P57081 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR4P57081 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR4P57081 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR4P57081 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR4P57081 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR4P57081 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR4P57081 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR4P57081 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR4P57081 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR4P57081 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR4P57081 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR4P57081 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR4P57081 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR4P57081 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR4P57081 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR4P57081 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR4P57081 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR4P57081 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR4P57081 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR4P57081 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR4P57081 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR4P57081 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms