Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms