Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms