Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP9P55211 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP9P55211 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP9P55211 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms