Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms