Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC5A3P53794 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms