Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP2P53365 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms