Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP2P50120 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBP2P50120 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBP2P50120 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RBP2P50120 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBP2P50120 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBP2P50120 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBP2P50120 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RBP2P50120 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBP2P50120 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RBP2P50120 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RBP2P50120 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBP2P50120 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RBP2P50120 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBP2P50120 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RBP2P50120 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBP2P50120 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBP2P50120 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RBP2P50120 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBP2P50120 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RBP2P50120 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBP2P50120 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBP2P50120 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBP2P50120 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBP2P50120 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RBP2P50120 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RBP2P50120 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
RBP2P50120 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RBP2P50120 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms