Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms