Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPIAP49247 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPIAP49247 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPIAP49247 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPIAP49247 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPIAP49247 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPIAP49247 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPIAP49247 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPIAP49247 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPIAP49247 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPIAP49247 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPIAP49247 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPIAP49247 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPIAP49247 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPIAP49247 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPIAP49247 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPIAP49247 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPIAP49247 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPIAP49247 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPIAP49247 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPIAP49247 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPIAP49247 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPIAP49247 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPIAP49247 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPIAP49247 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPIAP49247 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPIAP49247 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPIAP49247 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPIAP49247 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPIAP49247 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPIAP49247 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPIAP49247 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPIAP49247 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPIAP49247 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPIAP49247 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPIAP49247 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPIAP49247 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPIAP49247 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPIAP49247 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPIAP49247 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RPIAP49247 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPIAP49247 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPIAP49247 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPIAP49247 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPIAP49247 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPIAP49247 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPIAP49247 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RPIAP49247 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RPIAP49247 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPIAP49247 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPIAP49247 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPIAP49247 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPIAP49247 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPIAP49247 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPIAP49247 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPIAP49247 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPIAP49247 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPIAP49247 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPIAP49247 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPIAP49247 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPIAP49247 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPIAP49247 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPIAP49247 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPIAP49247 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPIAP49247 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPIAP49247 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPIAP49247 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPIAP49247 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RPIAP49247 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms