Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNNI2P48788 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms