Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NESP48681 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NESP48681 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NESP48681 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NESP48681 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NESP48681 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NESP48681 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NESP48681 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NESP48681 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NESP48681 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NESP48681 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NESP48681 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NESP48681 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NESP48681 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NESP48681 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NESP48681 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NESP48681 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NESP48681 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NESP48681 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NESP48681 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NESP48681 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NESP48681 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NESP48681 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NESP48681 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NESP48681 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NESP48681 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NESP48681 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NESP48681 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NESP48681 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NESP48681 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NESP48681 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NESP48681 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NESP48681 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NESP48681 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NESP48681 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NESP48681 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NESP48681 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NESP48681 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NESP48681 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NESP48681 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NESP48681 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NESP48681 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NESP48681 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NESP48681 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NESP48681 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NESP48681 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NESP48681 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NESP48681 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NESP48681 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NESP48681 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NESP48681 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NESP48681 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NESP48681 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NESP48681 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NESP48681 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NESP48681 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NESP48681 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NESP48681 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NESP48681 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NESP48681 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NESP48681 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NESP48681 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NESP48681 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NESP48681 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NESP48681 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NESP48681 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NESP48681 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NESP48681 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NESP48681 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NESP48681 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NESP48681 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NESP48681 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NESP48681 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NESP48681 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NESP48681 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NESP48681 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NESP48681 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NESP48681 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NESP48681 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NESP48681 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NESP48681 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NESP48681 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NESP48681 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NESP48681 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NESP48681 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NESP48681 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NESP48681 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NESP48681 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NESP48681 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NESP48681 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NESP48681 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NESP48681 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NESP48681 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NESP48681 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NESP48681 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
NESP48681 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
NESP48681 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
NESP48681 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
NESP48681 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
NESP48681 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms