Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms