Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM5CP41229 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms