Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC26A3P40879 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC26A3P40879 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC26A3P40879 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC26A3P40879 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC26A3P40879 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC26A3P40879 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC26A3P40879 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC26A3P40879 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC26A3P40879 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC26A3P40879 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC26A3P40879 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC26A3P40879 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC26A3P40879 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC26A3P40879 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC26A3P40879 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC26A3P40879 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC26A3P40879 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms