Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms