Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PPARGP37231 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PPARGP37231 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PPARGP37231 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms