Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD13P35453 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms