Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP6P35125 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP6P35125 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP6P35125 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP6P35125 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP6P35125 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP6P35125 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP6P35125 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP6P35125 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP6P35125 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP6P35125 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP6P35125 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP6P35125 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP6P35125 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP6P35125 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP6P35125 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP6P35125 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP6P35125 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP6P35125 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP6P35125 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP6P35125 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP6P35125 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP6P35125 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP6P35125 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP6P35125 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP6P35125 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP6P35125 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP6P35125 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP6P35125 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP6P35125 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP6P35125 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP6P35125 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP6P35125 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP6P35125 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP6P35125 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP6P35125 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP6P35125 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP6P35125 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP6P35125 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP6P35125 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP6P35125 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP6P35125 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP6P35125 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP6P35125 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP6P35125 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP6P35125 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP6P35125 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP6P35125 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP6P35125 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP6P35125 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP6P35125 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP6P35125 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP6P35125 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP6P35125 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP6P35125 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP6P35125 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP6P35125 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP6P35125 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6P35125 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6P35125 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6P35125 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6P35125 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6P35125 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6P35125 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6P35125 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6P35125 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6P35125 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6P35125 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6P35125 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6P35125 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6P35125 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6P35125 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6P35125 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6P35125 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6P35125 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6P35125 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6P35125 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6P35125 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6P35125 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6P35125 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6P35125 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6P35125 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6P35125 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP6P35125 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6P35125 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6P35125 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6P35125 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6P35125 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6P35125 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6P35125 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6P35125 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6P35125 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6P35125 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6P35125 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6P35125 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6P35125 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6P35125 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6P35125 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6P35125 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP6P35125 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms