Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLD1P28340 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLD1P28340 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLD1P28340 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLD1P28340 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLD1P28340 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLD1P28340 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLD1P28340 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLD1P28340 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLD1P28340 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLD1P28340 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLD1P28340 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLD1P28340 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLD1P28340 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLD1P28340 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLD1P28340 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLD1P28340 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLD1P28340 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLD1P28340 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
POLD1P28340 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLD1P28340 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLD1P28340 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLD1P28340 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLD1P28340 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLD1P28340 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLD1P28340 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLD1P28340 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLD1P28340 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLD1P28340 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLD1P28340 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLD1P28340 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
POLD1P28340 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLD1P28340 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLD1P28340 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLD1P28340 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLD1P28340 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
POLD1P28340 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLD1P28340 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLD1P28340 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLD1P28340 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLD1P28340 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLD1P28340 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
POLD1P28340 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLD1P28340 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLD1P28340 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLD1P28340 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLD1P28340 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLD1P28340 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLD1P28340 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
POLD1P28340 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLD1P28340 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLD1P28340 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLD1P28340 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLD1P28340 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLD1P28340 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
POLD1P28340 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
POLD1P28340 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLD1P28340 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLD1P28340 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLD1P28340 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLD1P28340 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLD1P28340 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
POLD1P28340 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLD1P28340 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLD1P28340 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLD1P28340 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
POLD1P28340 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLD1P28340 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLD1P28340 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLD1P28340 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLD1P28340 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLD1P28340 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLD1P28340 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLD1P28340 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLD1P28340 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLD1P28340 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLD1P28340 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLD1P28340 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLD1P28340 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLD1P28340 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLD1P28340 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLD1P28340 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLD1P28340 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLD1P28340 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLD1P28340 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLD1P28340 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLD1P28340 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLD1P28340 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLD1P28340 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLD1P28340 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLD1P28340 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLD1P28340 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLD1P28340 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLD1P28340 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLD1P28340 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLD1P28340 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLD1P28340 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLD1P28340 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLD1P28340 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLD1P28340 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms