Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms