Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA3P26006 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms