Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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