Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRBP23467 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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