Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA6P23229 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA6P23229 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA6P23229 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA6P23229 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA6P23229 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA6P23229 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA6P23229 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA6P23229 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA6P23229 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA6P23229 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA6P23229 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA6P23229 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA6P23229 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ITGA6P23229 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA6P23229 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA6P23229 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ITGA6P23229 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA6P23229 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA6P23229 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA6P23229 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA6P23229 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA6P23229 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA6P23229 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms