Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM21P19474 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms