Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA1P14867 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms