Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC130P13994 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms