Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms