Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXD8P13378 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXD8P13378 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms