Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD8BP10966 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD8BP10966 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD8BP10966 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD8BP10966 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD8BP10966 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD8BP10966 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD8BP10966 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD8BP10966 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms