Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NR2F1P10589 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms