Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJB1P08034 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJB1P08034 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJB1P08034 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJB1P08034 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJB1P08034 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJB1P08034 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJB1P08034 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJB1P08034 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJB1P08034 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJB1P08034 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJB1P08034 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB1P08034 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB1P08034 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GJB1P08034 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms