Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLK3P07288 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLK3P07288 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLK3P07288 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLK3P07288 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLK3P07288 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KLK3P07288 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLK3P07288 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLK3P07288 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLK3P07288 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLK3P07288 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLK3P07288 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLK3P07288 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms