Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAVP06756 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAVP06756 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAVP06756 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAVP06756 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAVP06756 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAVP06756 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGAVP06756 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGAVP06756 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGAVP06756 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGAVP06756 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGAVP06756 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGAVP06756 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGAVP06756 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGAVP06756 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGAVP06756 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGAVP06756 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms