Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX7O95931 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX7O95931 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX7O95931 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX7O95931 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX7O95931 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX7O95931 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX7O95931 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX7O95931 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX7O95931 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX7O95931 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX7O95931 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX7O95931 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX7O95931 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX7O95931 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX7O95931 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX7O95931 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX7O95931 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX7O95931 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX7O95931 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX7O95931 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX7O95931 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX7O95931 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX7O95931 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms