Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAPGEF3O95398 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAPGEF3O95398 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAPGEF3O95398 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAPGEF3O95398 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAPGEF3O95398 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAPGEF3O95398 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAPGEF3O95398 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms