Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNSO60931 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNSO60931 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNSO60931 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNSO60931 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNSO60931 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNSO60931 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNSO60931 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNSO60931 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNSO60931 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNSO60931 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNSO60931 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNSO60931 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNSO60931 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNSO60931 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNSO60931 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNSO60931 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNSO60931 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNSO60931 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNSO60931 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNSO60931 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNSO60931 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNSO60931 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNSO60931 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNSO60931 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNSO60931 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNSO60931 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNSO60931 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNSO60931 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNSO60931 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNSO60931 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNSO60931 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNSO60931 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNSO60931 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNSO60931 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNSO60931 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNSO60931 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNSO60931 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNSO60931 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNSO60931 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNSO60931 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNSO60931 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNSO60931 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNSO60931 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNSO60931 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNSO60931 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNSO60931 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNSO60931 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNSO60931 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNSO60931 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNSO60931 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNSO60931 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNSO60931 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNSO60931 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNSO60931 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNSO60931 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNSO60931 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNSO60931 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNSO60931 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNSO60931 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNSO60931 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNSO60931 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNSO60931 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNSO60931 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNSO60931 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNSO60931 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNSO60931 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNSO60931 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNSO60931 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms