Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC3O60481 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC3O60481 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC3O60481 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC3O60481 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC3O60481 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZIC3O60481 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms