Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EDIL3O43854 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms