Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SGSM2O43147 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SGSM2O43147 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SGSM2O43147 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SGSM2O43147 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SGSM2O43147 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SGSM2O43147 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SGSM2O43147 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SGSM2O43147 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGSM2O43147 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGSM2O43147 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGSM2O43147 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGSM2O43147 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms