Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNPHO15079 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNPHO15079 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNPHO15079 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNPHO15079 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNPHO15079 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNPHO15079 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNPHO15079 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNPHO15079 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNPHO15079 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNPHO15079 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNPHO15079 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNPHO15079 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNPHO15079 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNPHO15079 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNPHO15079 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNPHO15079 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNPHO15079 RPS26-201ENST00000356464 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNPHO15079 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNPHO15079 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNPHO15079 AC099542.2-201ENST00000474149 553 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNPHO15079 LINC02270-202ENST00000515691 541 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNPHO15079 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNPHO15079 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNPHO15079 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNPHO15079 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNPHO15079 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNPHO15079 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNPHO15079 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNPHO15079 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNPHO15079 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNPHO15079 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNPHO15079 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNPHO15079 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNPHO15079 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNPHO15079 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNPHO15079 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNPHO15079 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNPHO15079 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNPHO15079 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNPHO15079 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNPHO15079 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNPHO15079 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNPHO15079 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNPHO15079 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNPHO15079 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNPHO15079 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNPHO15079 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNPHO15079 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNPHO15079 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNPHO15079 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNPHO15079 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNPHO15079 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNPHO15079 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNPHO15079 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNPHO15079 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNPHO15079 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNPHO15079 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNPHO15079 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNPHO15079 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNPHO15079 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNPHO15079 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNPHO15079 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms