Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms