Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APAF1O14727 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APAF1O14727 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APAF1O14727 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
APAF1O14727 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APAF1O14727 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APAF1O14727 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APAF1O14727 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APAF1O14727 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
APAF1O14727 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APAF1O14727 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APAF1O14727 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APAF1O14727 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APAF1O14727 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
APAF1O14727 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APAF1O14727 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
APAF1O14727 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APAF1O14727 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APAF1O14727 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APAF1O14727 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
APAF1O14727 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APAF1O14727 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APAF1O14727 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APAF1O14727 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APAF1O14727 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APAF1O14727 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APAF1O14727 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APAF1O14727 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APAF1O14727 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APAF1O14727 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APAF1O14727 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
APAF1O14727 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APAF1O14727 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
APAF1O14727 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APAF1O14727 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APAF1O14727 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APAF1O14727 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APAF1O14727 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APAF1O14727 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APAF1O14727 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APAF1O14727 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APAF1O14727 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APAF1O14727 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APAF1O14727 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APAF1O14727 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APAF1O14727 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APAF1O14727 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APAF1O14727 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APAF1O14727 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APAF1O14727 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APAF1O14727 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APAF1O14727 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APAF1O14727 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APAF1O14727 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APAF1O14727 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APAF1O14727 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APAF1O14727 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APAF1O14727 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APAF1O14727 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APAF1O14727 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APAF1O14727 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APAF1O14727 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APAF1O14727 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APAF1O14727 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APAF1O14727 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APAF1O14727 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APAF1O14727 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms