Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRTO14522 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRTO14522 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
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