Protein–RNA interactions for Protein: K7EIQ3

ZNF561-AS1, Uncharacterized protein ZNF561-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ZNF561-AS1K7EIQ3 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms