Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms