Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

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Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRRM5B3KS81 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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